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英特尔、联想携手华大基因,加速新型冠状病毒基因组分析

发布时间:2020-03-03作者:智汇婷婷

英特尔、联想以及华大基因今天宣布,三家公司正携手加快COVID-19新型冠状病毒的基因组特性分析。来自英特尔及联想的专业技术与生命科学专家将通力合作,为华大基因的研究人员提供全新的大数据分析技术和计算资源,进一步提升其基因测序工具的分析能力,更高效地研究新型冠状病毒的基因组特性。


实验人员正在操作华大DNBSEQ-T7测序仪


英特尔和联想携手为华大基因提供的技术包括一个大型高性能计算集群,可用于处理从华大DNBSEQ-T7 测序系统读取的高通量数据。华大基因的研究人员将能够通过全新的高性能计算和基因组分析技术,以及英特尔和联想的相关资源和专业知识,进一步加速他们对新型冠状病毒的基因组特性研究。该技术将支持科学家研究病毒的毒性、传播模式、病原体与宿主间的相互作用,进而助力流行病学及疫苗设计研究。这些工作对于未来创建更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护性措施(例如免疫疗法)是非常必要的。


通过这项合作,华大基因将得以继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒并获取大量有价值的信息。这些信息将有助于确定将来开发有效疫苗或治疗方法的潜在靶标。通过英特尔和联想的共同努力,联想的超算技术支持并优化了“基因组优化和可扩展性工具”,(简称GOAST,首个获得英特尔®精选解决方案验证的基因组分析工具),可为全基因组测序和全外显子测序的计算提供高达40倍I的加速,助力华大基因优化计算过程,高效处理数据,更快地生成可靠的基因组分析成果,从而缩短科研和临床观察的时间。


“目前我们对这个新型冠状病毒还有很多不了解的地方。华大基因通过分析病毒基因组数据,加速对感染者的快速识别和基因组特性的研究,而这些工作需要投入巨大的计算资源,这恰恰是我们可以发挥作用的地方。”英特尔市场营销集团副总裁兼中国区总经理王锐表示,“因此,我们紧密携手,为正在防疫一线进行病毒研究的科学家提供更多的计算资源和专业支持,希望与狡猾的病毒赛跑,助力疫情防控,拯救更多生命。”


华大DNBSEQ-T7测序仪


联想集团高级副总裁、企业科技集团总裁童夫尧表示:“新型冠状病毒肺炎的疫情牵动着全国人民的心。联想作为全球领先的HPC厂商,一直致力于为生命科学研究提供计算力支持。来自英特尔及联想的大数据分析和健康与生命科学方面的专家,将整合我们的资源及专业技术,帮助解决目前面临的严峻挑战,推动健康和生命科学的发展进程。”


在基因测序工作中,每毫升体液通常会包含数百万个不同的病毒体,而每个病毒体的基因组则包含大约30,000个DNA碱基或字母。华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行基因测序,因此这些研究工作将会生成TB级乃至PB级的海量数据。要想高效地快速处理这些重要数据,就需要采用更为先进的HPC基础架构、计算技术以及优化的基因组分析方法。


华大基因总部位于深圳,是全球领先的专注于生命科学和基因研究的公司之一。 华大基因首席信息官晋向前表示:“华大基因已对数百份临床样本进行了测序,以分析和区分感染的并发症。生物信息学领域的技术,例如基因组比对、基因组组装、基因组注释和病毒核酸片段的系统分析,是一个高密度的计算过程,因此足够的高性能计算对于提高分析效率至关重要。能够使用最新的高性能计算和基因组分析技术是提高分析效率的重要因素。该设备和技术将加快对新型冠状病毒感染者的快速识别和病毒基因组特性的研究,为新型冠状病毒的精准诊断、治疗和疫情防控提供强有力的支持。”

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宜科(天津)电子有限公司是中国工业自动化的领军企业,于2003年在天津投资成立,销售和服务网络覆盖全国。作为中国本土工业自动化产品的提供商和智能制造解决方案的供应商,宜科在汽车、汽车零部件、工程机械、机器人、食品制药、印刷包装、纺织机械、物流设备、电子制造等诸多领域占据领先地位。宜科为智慧工厂的整体规划实施提供自系统层、控制层、网络层到执行层自上而下的全系列服务,产品及解决方案涵盖但不局限于云平台、MES制造执行系统、工业现场总线、工业以太网、工业无线通讯、机器人及智能设备组成的自动化生产线、自动化电气控制系统集成、智能物流仓储系统等,以实现真正智能化的生产制造,从而带来生产力和生产效率的大幅提升,以及对生产灵活性和生产复杂性的管理能力的大幅提升。多年来,宜科以创新的技术、卓越的解决方案和产品坚持不懈地为中国制造业的发展提供全面支持,并以出众的品质和令人信赖的可靠性、领先的技术成就、不懈的创新追求,在业界独树一帜。帮助中国制造业转型升级,加速智能制造进程,成为中国工业4.0智慧工厂解决方案当之无愧的践行者。

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